KLINIK DR WIDODO JUDARWANTO pediatrician

Imunopatofisiologi Virus Corona Covid19

Spread the love

Immunopatofisiologi Infeksi Virus Corona Covid19

Widodo Judarwanto, Audi Yudhasmara

Sebuah virus corona jenis baru yang disebut sebagai Covid19, diidentifikasi di Wuhan, provinsi Hubei, Cina, setelah beberapa orang ditemukan mengalami pneumonia tanpa sebab yang jelas dan yang vaksin atau perawatan yang ada tidak efektif. Virus ini telah menunjukkan bukti penularan dari manusia ke manusia dan laju penularannya (tingkat infeksi) tampaknya meningkat pada pertengahan Januari 2020, dengan beberapa negara selain Cina yang melaporkan kasus. Masa inkubasi (waktu dari paparan gejala yang berkembang) dari virus adalah antara 2 dan 14 hari dan tetap menular selama waktu ini. Gejalanya meliputi demam, batuk dan kesulitan bernafas dan bisa berakibat fatal.

Sekelompok kasus pneumonia baru-baru ini di Wuhan, Cina, disebabkan oleh betacoronavirus novel, coronavirus novel 2019 (2019-nCoV). Dolaporkan karakteristik epidemiologis, klinis, laboratorium, dan radiologis serta pengobatan dan hasil klinis pasien ini. Semua pasien dengan dugaan 2019-nCoV dirawat di rumah sakit yang ditunjuk di Wuhan. Peniliti secara prospektif mengumpulkan dan menganalisis data pada pasien dengan infeksi 2019-nCoV yang dikonfirmasi oleh laboratorium dengan RT-PCR real-time dan sequencing generasi berikutnya. Data diperoleh dengan formulir pengumpulan data standar yang dibagikan oleh Konsorsium Infeksi Akut Parah Internasional dan yang muncul dari catatan medis elektronik. Para peneliti juga secara langsung berkomunikasi dengan pasien atau keluarga mereka untuk memastikan data epidemiologis dan gejala. Hasil juga dibandingkan antara pasien yang telah dirawat di unit perawatan intensif (ICU) dan mereka yang tidak.

Manifestasi klinis

  • Pada 2 Januari 2020, 41 pasien dirawat di rumah sakit telah diidentifikasi memiliki infeksi 2019-nCoV yang dikonfirmasi laboratorium. Sebagian besar pasien yang terinfeksi adalah laki-laki (30 [73%] dari 41); kurang dari setengahnya memiliki penyakit yang mendasarinya (13 [32%]), termasuk diabetes (delapan [20%]), hipertensi (enam [15%]), dan penyakit kardiovaskular (enam [15%]). Usia rata-rata adalah 49 · 0 tahun (IQR 41 · 0–58 · 0). 27 (66%) dari 41 pasien telah terpapar ke pasar makanan laut Huanan.
  • Satu kluster keluarga ditemukan. Gejala umum pada awal penyakit adalah demam (40 [98%] dari 41 pasien), batuk (31 [76%]), dan mialgia atau kelelahan (18 [44%]); gejala yang kurang umum adalah produksi dahak (11 [28%] dari 39), sakit kepala (tiga [8%] dari 38), hemoptisis (dua [5%] dari 39), dan diare (satu [3%] dari 38). Dyspnoea berkembang pada 22 (55%) dari 40 pasien (waktu rata-rata dari onset penyakit menjadi dyspnoea 8 · 0 hari [IQR 5 · 0–13 · 0]). 26 (63%) dari 41 pasien menderita limfopenia.
  • Semua 41 pasien memiliki pneumonia dengan temuan abnormal pada CT dada. Komplikasi termasuk sindrom gangguan pernapasan akut (12 [29%]), RNAaemia (enam [15%]), cedera jantung akut (lima [12%]) dan infeksi sekunder (empat [10%]). 13 (32%) pasien dirawat di ICU dan enam (15%) meninggal.
  • Dibandingkan dengan pasien non-ICU, pasien ICU memiliki kadar IL2, IL7, IL10, GSCF, IP10, MCP1, MIP1A, dan TNFα plasma yang lebih tinggi.

Pengukuran sitokin dan kemokin

  • Pada penderita 2019-nCoV telah dilakukan pengukuran sitokin dan kemokin. Untuk mengkarakterisasi efek coronavirus pada produksi sitokin atau kemokin pada fase akut penyakit, sitokin plasma dan kemokin (IL1B, IL1RA, IL2, IL4, IL5, IL6, IL7, IL8 (juga dikenal sebagai CXCL8), IL9, IL10, IL12p70, IL13, IL15, IL17A, Eotaxin (juga dikenal sebagai CCL11), FGF2 dasar, GCSF (CSF3), GMCSF (CSF2), IFNγ, IP10 (CXCL10), MCP1 (CCL2), MIP1A (CCL3), MIP1B ( CCL4), PDGFB, RANTES (CCL5), TNFα, dan VEGFA diukur menggunakan panel Human Cytokine Standard 27-Plex Assays dan sistem Bio-Plex 200 (Bio-Rad, Hercules, CA, USA) untuk semua pasien sesuai dengan pabriknya.
  • Sampel plasma dari empat orang dewasa yang sehat digunakan sebagai kontrol untuk perbandingan silang. Waktu median dari dipindahkan ke rumah sakit yang ditunjuk untuk pengumpulan sampel darah adalah 4 hari (IQR 2-5).

Penyebab

  • CoV adalah virus RNA untai positif dengan penampilan seperti mahkota di bawah mikroskop elektron (coronam adalah istilah Latin untuk mahkota) karena adanya lonjakan glikoprotein pada amplop. Subfamili Orthocoronavirinae dari keluarga Coronaviridae (orde Nidovirales) digolongkan ke dalam empat gen CoV: Alphacoronavirus (alphaCoV), Betacoronavirus (betaCoV), Deltacoronavirus (deltaCoV), dan Gammacoronavirus (deltaCoV). Selanjutnya, genus betaCoV membelah menjadi lima sub-genera atau garis keturunan. [2] Karakterisasi genom telah menunjukkan bahwa mungkin kelelawar dan tikus adalah sumber gen alphaCoVs dan betaCoVs. Sebaliknya, spesies burung tampaknya mewakili sumber gen deltaCoVs dan gammaCoVs.
  • Anggota keluarga besar virus ini dapat menyebabkan penyakit pernapasan, enterik, hati, dan neurologis pada berbagai spesies hewan, termasuk unta, sapi, kucing, dan kelelawar. Sampai saat ini, tujuh CoV manusia (HCV) – yang mampu menginfeksi manusia – telah diidentifikasi. Beberapa HCoV diidentifikasi pada pertengahan 1960-an, sementara yang lain hanya terdeteksi pada milenium baru.
  • Secara umum, perkiraan menunjukkan bahwa 2% dari populasi adalah pembawa CoV yang sehat dan bahwa virus ini bertanggung jawab atas sekitar 5% hingga 10% dari infeksi pernapasan akut.
    • CoV manusia pada umumnya: HCoV-OC43, dan HCoV-HKU1 (betaCoVs dari garis keturunan A); HCoV-229E, dan HCoV-NL63 (alphaCoVs). Mereka dapat menyebabkan pilek dan infeksi pernafasan atas yang sembuh sendiri pada individu yang imunokompeten. Pada subjek yang mengalami gangguan kekebalan dan orang tua, infeksi saluran pernapasan bagian bawah dapat terjadi.
    • CoV manusia lainnya: SARS-CoV, SARS-CoV-2, dan MERS-CoV (betaCoVs dari garis keturunan B dan C, masing-masing). Ini menyebabkan epidemi dengan tingkat keparahan klinis bervariasi dengan manifestasi pernapasan dan ekstra-pernapasan. Mengenai SARS-CoV, MERS-CoV, angka kematian masing-masing hingga 10% dan 35%.
  • Dengan demikian, SARS-CoV-2 termasuk dalam kategori betaCoVs. Ini memiliki bentuk bulat atau elips dan sering pleomorfik, dan diameter sekitar 60-140 nm. Seperti CoV lainnya, ia sensitif terhadap sinar ultraviolet dan panas. Lebih lanjut, virus-virus ini dapat secara efektif dinonaktifkan oleh pelarut lipid termasuk eter (75%), etanol, desinfektan yang mengandung klorin, asam peroksiasetat dan kloroform kecuali untuk klorheksidin.
  • Dalam istilah genetik, Chan dkk telah membuktikan bahwa genom HCoV baru, yang diisolasi dari pasien cluster dengan pneumonia atipikal setelah mengunjungi Wuhan, memiliki 89% identitas nukleotida dengan kelelawar SARS-seperti-CoVZXC21 dan 82% dengan gen manusia SARS-CoV. Untuk alasan ini, virus baru itu bernama SARS-CoV-2. Genom RNA untai tunggal-nya mengandung 29891 nukleotida, yang mengkode 9860 asam amino. Meskipun asalnya tidak sepenuhnya dipahami, analisis genom ini menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 mungkin berevolusi dari strain yang ditemukan pada kelelawar. Namun, potensi mamalia yang memperkuat, perantara antara kelelawar dan manusia, belum diketahui. Karena mutasi pada strain asli bisa secara langsung memicu virulensi terhadap manusia, tidak pasti bahwa perantara ini ada.
BACA  Cara Amerika Mencegah Penyebaran Covid19, Isolasi Ketat

Imunopatofisiologi

  • Pemahaman tentang patofisiologi dan patogenesis penyakit virus saat ini masih terbatas. Setelah kontaminasi, kebanyakan virus pernapasan cenderung berkembang biak di epitel saluran napas bagian atas dan menginfeksi paru-paru dengan cara sekresi jalan napas atau penyebaran hematogen. Pneumonia berat dapat menyebabkan konsolidasi luas paru-paru dengan berbagai tingkat perdarahan, dengan beberapa pasien mengembangkan efusi pleura berdarah dan kerusakan alveolar difus.
  • Mekanisme kerusakan jaringan tergantung pada virus yang terlibat. Beberapa virus terutama sitopatik, yang secara langsung mempengaruhi pneumosit atau sel-sel bronkial. Dengan yang lain, peradangan berlebihan dari respon imun adalah andalan dari proses patogen.
  • Patogenesis utama infeksi COVID-19 sebagai virus penargetan sistem pernapasan adalah pneumonia berat, RNAaemia, dikombinasikan dengan kejadian kekeruhan tanah-kaca, dan infark jantung akut.
  • Respons kekebalan dapat dikategorikan menurut pola produksi sitokin. Sitokin tipe 1 meningkatkan imunitas yang dimediasi sel, sedangkan sitokin tipe 2 memediasi respons alergi. Anak-anak yang terinfeksi virus pernapasan syncytial (RSV) yang mengembangkan bronkiolitis akut, daripada gejala infeksi pernapasan atas ringan, telah merusak imunitas tipe 1 atau imunitas tipe 2 tambahan.
  • Selain tanggapan humoral, kekebalan yang diperantarai sel tampaknya penting untuk pemulihan dari infeksi virus pernapasan tertentu. Respons tipe 1 yang terganggu dapat menjelaskan mengapa pasien yang mengalami gangguan kekebalan memiliki pneumonia virus yang lebih parah.
  • Virus pernapasan merusak saluran pernapasan dan menstimulasi inang untuk melepaskan banyak faktor humoral, termasuk histamin, leukotrien C4, dan IgE spesifik virus pada infeksi RSV dan bradikinin, interleukin (IL) –1, IL-6, dan IL-8 dalam rhinovirus infeksi. Infeksi RSV juga dapat mengubah pola kolonisasi bakteri, meningkatkan kepatuhan bakteri pada epitel pernapasan, mengurangi pembersihan mukosiliar, dan mengubah fagositosis bakteri oleh sel inang.
  • Pasien yang terinfeksi COVID-19 menunjukkan jumlah leukosit yang lebih tinggi, temuan pernapasan abnormal, dan peningkatan kadar sitokin pro-inflamasi plasma. Salah satu laporan kasus COVID-19 menunjukkan seorang pasien yang menderita demam 5 hari mengalami batuk, bunyi napas kasar dari kedua paru-paru, dan suhu tubuh 39,0 ° C. Dahak pasien menunjukkan hasil reaksi rantai polimerase real-time positif yang mengkonfirmasi infeksi COVID-19. Studi laboratorium menunjukkan leukopenia dengan jumlah leukosit 2,91 × 10 ^ 9 sel / L di mana 70,0% adalah neutrofil. Selain itu, nilai 16,16 mg / L protein C-reaktif darah tercatat di atas kisaran normal (0-10 mg / L). Tingkat sedimentasi eritrosit yang tinggi dan D-dimer juga diamati
  • Kadar sitokin dan kemokin dalam darah yang sangat tinggi tercatat pada pasien dengan infeksi COVID-19 yang mencakup IL1-β, IL1RA, IL7, IL8, IL9, IL10, FGF2 dasar, GCSF, GMCSF, IFNγ, IP10, MCP1, MIP1α, MIP1β, PDGFB, TNFα, dan VEGFA. Beberapa kasus parah yang dirawat di unit perawatan intensif menunjukkan tingkat tinggi sitokin proinflamasi termasuk IL2, IL7, IL10, GCSF, IP10, MCP1, MIP1α, dan TNFα yang beralasan untuk meningkatkan keparahan penyakit.
  • CoV diselimuti, virus RNA untai positif dengan nukleokapsid. Untuk mengatasi mekanisme patogenetik SARS-CoV-2, struktur virusnya, dan genom harus menjadi pertimbangan. Dalam CoVs, struktur genom diatur dalam + ssRNA sekitar 30 kb panjangnya – virus RNA terbesar yang diketahui – dan dengan struktur 5′-tutup dan 3 tail-poli-A ekor. Mulai dari viral RNA, sintesis polyprotein 1a / 1ab (pp1a / pp1ab) di dalam host direalisasikan. Transkripsi bekerja melalui replikasi-transkripsi kompleks (RCT) yang diatur dalam vesikel membran ganda dan melalui sintesis urutan RNA subgenomik (sgRNA). Dari catatan, penghentian transkripsi terjadi pada urutan peraturan transkripsi, yang terletak di antara apa yang disebut open reading frames (ORFs) yang berfungsi sebagai templat untuk produksi mRNA subgenomik. Dalam genom CoV atipikal, setidaknya enam ORF dapat hadir. Di antara ini, sebuah frameshift antara ORF1a dan ORF1b memandu produksi polipeptida pp1a dan pp1ab yang diproses oleh protease seperti chymotrypsin (3CLpro) atau protease utama (Mpro) yang dikodekan secara virual untuk memproduksi 16 protein non-struktural (nsps). Terlepas dari ORF1a dan ORF1b, ORF lain mengkode protein struktural, termasuk protein lonjakan, membran, amplop, dan nukleokapsid. dan rantai protein aksesori. CoV yang berbeda menghadirkan protein struktural dan aksesori khusus yang diterjemahkan oleh sgRNA khusus.
  • Patofisiologi dan mekanisme virulensi CoV, dan karenanya SARS-CoV-2 memiliki hubungan dengan fungsi nsps dan protein struktural. Misalnya, penelitian menggarisbawahi bahwa nsp mampu memblokir inang respon imun bawaan. Di antara fungsi protein struktural, amplop memiliki peran penting dalam patogenisitas virus karena mempromosikan perakitan dan pelepasan virus. Namun, banyak fitur ini (mis., Fitur nsp 2, dan 11) belum dijelaskan.
  • Di antara elemen struktural CoV, ada glikoprotein lonjakan yang terdiri dari dua subunit (S1 dan S2). Homotrimer protein S menyusun paku pada permukaan virus, memandu tautan untuk menjadi tuan rumah reseptor. Sebagai catatan, dalam SARS-CoV-2, subunit S2 – yang mengandung peptida fusi, domain transmembran, dan domain sitoplasma – sangat dilestarikan. Dengan demikian, itu bisa menjadi target untuk senyawa antivirus (anti-S2). Sebaliknya, domain pengikat reseptor lonjakan hanya menyajikan identitas asam amino 40% dengan SARS-CoVs lainnya. Elemen struktural lain yang harus menjadi fokus penelitian adalah ORF3b yang tidak memiliki homologi dengan SARS-CoVs dan protein yang disekresikan (dikodekan oleh ORF8), yang secara struktural berbeda dari SARS-CoV.
  • Di bank gen internasional seperti GenBank, para peneliti telah menerbitkan beberapa sekuens gen Sars-CoV-2. Pemetaan gen ini sangat penting yang memungkinkan para peneliti untuk melacak pohon filogenetik virus dan, di atas semua itu, pengakuan strain yang berbeda sesuai dengan mutasi. Menurut penelitian terbaru, mutasi lonjakan, yang mungkin terjadi pada akhir November 2019, memicu lompatan ke manusia. Secara khusus, Angeletti et al. membandingkan urutan gen Sars-Cov-2 dengan urutan Sars-CoV. Mereka menganalisis segmen heliks transmembran dalam ORF1ab yang dikodekan 2 (nsp2) dan nsp3 dan menemukan bahwa posisi 723 menyajikan serin alih-alih residu glisin, sedangkan posisi 1010 ditempati oleh prolin bukan isoleusin. Masalah mutasi virus adalah kunci untuk menjelaskan kekambuhan penyakit potensial.
  • Penelitian akan diperlukan untuk menentukan karakteristik struktural SARS-COV-2 yang mendasari mekanisme patogenetik. Dibandingkan dengan SARS, misalnya, data klinis awal menunjukkan keterlibatan pernafasan yang lebih sedikit, meskipun karena kurangnya data yang luas, tidak mungkin untuk menarik informasi klinis yang pasti.
BACA  Epidemiologi dan Pandemi Koronavirus Covid19 2019–2020 

Histopatologi

  • Tian dkk dan para peniliti lainnya melaporkan data histopatologis yang diperoleh pada paru-paru dari dua pasien yang menjalani lobektomi paru-paru untuk adenokarsinoma dan secara retrospektif ditemukan memiliki infeksi pada saat operasi. Terlepas dari tumor, paru-paru dari kedua kasus ‘kebetulan’ menunjukkan edema dan eksudat protein penting sebagai gumpalan protein besar. Para penulis juga melaporkan kemacetan pembuluh darah yang dikombinasikan dengan kelompok inflamasi dari bahan fibrinoid dan sel raksasa berinti banyak serta hiperplasia pneumosit.

Referensi

  • Levy MM, Baylor MS, Bernard GR, Fowler R, Franks TJ, Hayden FG, et al. Clinical issues and research in respiratory failure from severe acute respiratory syndrome. Am J Respir Crit Care Med. 2005 Mar 1. 171(5):518-26.
  • Legg JP, Hussain IR, Warner JA, Johnston SL, Warner JO. Type 1 and type 2 cytokine imbalance in acute respiratory syncytial virus bronchiolitis. Am J Respir Crit Care Med. 2003 Sep 15. 168(6):633-9.
  • Katsurada N, Suzuki M, Aoshima M, Yaegashi M, Ishifuji T, Asoh N, et al. The impact of virus infections on pneumonia mortality is complex in adults: a prospective multicentre observational study. BMC Infect Dis. 2017 Dec 6. 17 (1):755.
  • R. Lu, X. Zhao, J. Li, P. Niu, B. Yang, H. Wu, et al.Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding Lancet, 395 (10224) (2020), pp. 565-574,
  • Y. Wan, J. Shang, R. Graham, R.S. Baric, F. LiReceptor recognition by novel coronavirus from Wuhan: an analysis based on decade-long structural studies of SARS J. Virol. (2020), 10.1128/JVI.00127-20
  • Perlman S, Netland J. Coronaviruses post-SARS: update on replication and pathogenesis. Nat. Rev. Microbiol. 2009 Jun;7(6):439-50.
  • Chan JF, To KK, Tse H, Jin DY, Yuen KY. Interspecies transmission and emergence of novel viruses: lessons from bats and birds. Trends Microbiol. 2013 Oct;21(10):544-55.
  • Chen Y, Liu Q, Guo D. Emerging coronaviruses: Genome structure, replication, and pathogenesis. J. Med. Virol. 2020 Apr;92(4):418-423.
  • Chan JF, Kok KH, Zhu Z, Chu H, To KK, Yuan S, Yuen KY. Genomic characterization of the 2019 novel human-pathogenic coronavirus isolated from a patient with atypical pneumonia after visiting Wuhan. Emerg Microbes Infect. 2020 Dec;9(1):221-236.
  • Li Q, Guan X, Wu P, Wang X, Zhou L, Tong Y, Ren R, Leung KSM, Lau EHY, Wong JY, Xing X, Xiang N, Wu Y, Li C, Chen Q, Li D, Liu T, Zhao J, Li M, Tu W, Chen C, Jin L, Yang R, Wang Q, Zhou S, Wang R, Liu H, Luo Y, Liu Y, Shao G, Li H, Tao Z, Yang Y, Deng Z, Liu B, Ma Z, Zhang Y, Shi G, Lam TTY, Wu JTK, Gao GF, Cowling BJ, Yang B, Leung GM, Feng Z. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. N. Engl. J. Med. 2020 Jan 29;
  • Bauch CT, Lloyd-Smith JO, Coffee MP, Galvani AP. Dynamically modeling SARS and other newly emerging respiratory illnesses: past, present, and future. Epidemiology. 2005 Nov;16(6):791-801.
BACA  Penelitian Penularan Lewat Fecal Oral Covid19

 

 

 

Материалы по теме:

Natrium Hipoklorit, Sebagai Cairan Bahan Disinfektan Paling Dianjurkan
Natrium hipoklorit, Sebagai Cairan Bahan Diinfektan Paling Dianjurkan Hipoklorit, desinfektan klorin yang paling banyak digunakan, tersedia dalam bentuk cair (mis., Natrium hipoklorit) atau padat (mis., ...
Pencegahan Penyakit Virus Corona Covid19 Dalam Lingkungan Masjid
Pencegahan Penyakit Virus Corona Covid19 Dalam Lingkungan Masjid Dr Widodo Judarwanto pediatrician Banyak yang harus dipelajari tentang coronavirus novel yang menyebabkan penyakit coronavirus 2019 (COVID-19). Berdasarkan ...
Langkah Pencegahan untuk melindungi pekerja dari paparan, dan infeksi coronavirus novel, COVID-19
Langkah Pencegahan untuk melindungi pekerja dari paparan, dan infeksi coronavirus novel, COVID-19 Langkah-langkah untuk melindungi pekerja dari paparan, dan infeksi dengan, coronavirus novel, COVID-19 tergantung ...
Rekomendasi Untuk Pengelola Penitipan Anak dan Sekolah Mencegah Penyakit Coronavirus 2019 (COVID-19).
Rekomendasi untuk pengelola Program Pengasuhan Anak AS dan Sekolah  untuk Merencanakan, Menyiapkan, dan Mencegah Penyakit Coronavirus 2019 (COVID-19). Panduan sementara ini didasarkan pada apa ...
Pembersihan Lingkungan dan Disinfeksi Untuk Mencegah Penyakit Coronavirus yang Diduga atau Dikonfirmasi 2019
Pembersihan Lingkungan dan Disinfeksi Untuk Mencegah Penyakit Coronavirus yang Diduga atau Dikonfirmasi 2019 Dr Widodo Judarwanto pediatrician Banyak yang harus dipelajari tentang coronavirus novel yang menyebabkan ...

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *

error

Enjoy this blog? Please spread the word :)