KLINIK DR WIDODO JUDARWANTO pediatrician

Karakteristik Hasil pemeriksaan Laboratorium Penderita Virus Corona (2019-nCoV) di Wuhan China

Spread the love

Widodo Judarwanto, Audi Yudhasmara

 

Sebuah coronavirus baru, yang disebut sebagai 2019-nCoV, diidentifikasi di Wuhan, provinsi Hubei, Cina, setelah beberapa orang ditemukan mengalami pneumonia tanpa sebab yang jelas dan yang vaksin atau perawatan yang ada tidak efektif. Virus ini telah menunjukkan bukti penularan dari manusia ke manusia dan laju penularannya (tingkat infeksi) tampaknya meningkat pada pertengahan Januari 2020,  dengan beberapa negara selain Cina yang melaporkan kasus. Masa inkubasi (waktu dari paparan gejala yang berkembang) dari virus adalah antara 2 dan 14 hari dan tetap menular selama waktu ini. Gejalanya meliputi demam, batuk dan kesulitan bernafas dan bisa berakibat fatal.

Sekelompok kasus pneumonia baru-baru ini di Wuhan, Cina, disebabkan oleh betacoronavirus novel, coronavirus novel 2019 (2019-nCoV). Dolaporkan karakteristik epidemiologis, klinis, laboratorium, dan radiologis serta pengobatan dan hasil klinis pasien ini.

Semua pasien dengan dugaan 2019-nCoV dirawat di rumah sakit yang ditunjuk di Wuhan. Peniliti secara prospektif mengumpulkan dan menganalisis data pada pasien dengan infeksi 2019-nCoV yang dikonfirmasi oleh laboratorium dengan RT-PCR real-time dan sequencing generasi berikutnya. Data diperoleh dengan formulir pengumpulan data standar yang dibagikan oleh Konsorsium Infeksi Akut Parah Internasional dan yang muncul dari catatan medis elektronik. Para peneliti juga secara langsung berkomunikasi dengan pasien atau keluarga mereka untuk memastikan data epidemiologis dan gejala. Hasil juga dibandingkan antara pasien yang telah dirawat di unit perawatan intensif (ICU) dan mereka yang tidak.

Pada 2 Januari 2020, 41 pasien dirawat di rumah sakit telah diidentifikasi memiliki infeksi 2019-nCoV yang dikonfirmasi laboratorium. Sebagian besar pasien yang terinfeksi adalah laki-laki (30 [73%] dari 41); kurang dari setengahnya memiliki penyakit yang mendasarinya (13 [32%]), termasuk diabetes (delapan [20%]), hipertensi (enam [15%]), dan penyakit kardiovaskular (enam [15%]). Usia rata-rata adalah 49 · 0 tahun (IQR 41 · 0–58 · 0). 27 (66%) dari 41 pasien telah terpapar ke pasar makanan laut Huanan. Satu kluster keluarga ditemukan. Gejala umum pada awal penyakit adalah demam (40 [98%] dari 41 pasien), batuk (31 [76%]), dan mialgia atau kelelahan (18 [44%]); gejala yang kurang umum adalah produksi dahak (11 [28%] dari 39), sakit kepala (tiga [8%] dari 38), hemoptisis (dua [5%] dari 39), dan diare (satu [3%] dari 38). Dyspnoea berkembang pada 22 (55%) dari 40 pasien (waktu rata-rata dari onset penyakit menjadi dyspnoea 8 · 0 hari [IQR 5 · 0–13 · 0]). 26 (63%) dari 41 pasien menderita limfopenia. Semua 41 pasien memiliki pneumonia dengan temuan abnormal pada CT dada. Komplikasi termasuk sindrom gangguan pernapasan akut (12 [29%]), RNAaemia (enam [15%]), cedera jantung akut (lima [12%]) dan infeksi sekunder (empat [10%]). 13 (32%) pasien dirawat di ICU dan enam (15%) meninggal. Dibandingkan dengan pasien non-ICU, pasien ICU memiliki kadar IL2, IL7, IL10, GSCF, IP10, MCP1, MIP1A, dan TNFα plasma yang lebih tinggi.

wp-1580094326184.jpg

Virus Corona

  • Infeksi 2019-nCoV menyebabkan kelompok penyakit pernapasan parah yang mirip dengan coronavirus severe acute respiratory syndrome  dan dikaitkan dengan masuknya ICU dan kematian yang tinggi. Kesenjangan utama dalam pengetahuan kita tentang asal, epidemiologi, durasi penularan manusia, dan spektrum klinis penyakit perlu dipenuhi oleh penelitian di masa depan.
  • Coronavirus adalah virus RNA indra-positif yang tidak tersegmentasi yang termasuk dalam keluarga Coronaviridae dan ordo Nidovirales dan didistribusikan secara luas pada manusia dan mamalia lainnya.1 Meskipun sebagian besar infeksi virus korona manusia bersifat ringan, epidemi kedua betacoronavirus, koronavirus sindrom pernapasan akut yang parah (SARS-CoV) 2, 3, 4 dan coronavirus syndrome pernapasan Timur Tengah (MERS-CoV), 5, 6 telah menyebabkan lebih dari 10.000 kasus kumulatif dalam dua dekade terakhir, dengan tingkat kematian 10% untuk SARS-CoV dan 37% untuk MERS-CoV.7, 8 Coronavirus yang telah diidentifikasi mungkin hanya merupakan puncak gunung es, dengan potensi kejadian zoonosis yang lebih baru dan parah untuk diungkapkan.
  • Pada bulan Desember, 2019, serangkaian kasus pneumonia yang penyebabnya tidak diketahui muncul di Wuhan, Hubei, Cina, dengan presentasi klinis sangat menyerupai pneumonia virus.9 Analisis dalam urutan dari sampel saluran pernapasan bawah menunjukkan coronavirus baru, yang diberi nama coronavirus novel 2019 ( 2019-nCoV). Sejauh ini, lebih dari 800 kasus yang dikonfirmasi, termasuk pada pekerja layanan kesehatan, telah diidentifikasi di Wuhan, dan beberapa kasus yang diekspor telah dikonfirmasi di provinsi lain di Cina, dan di Thailand, Jepang, Korea Selatan, dan Amerika Serikat.
Tabel 1 Karakteristik Hasil pemeriksaan laboratorium pasien yang terinfeksi 2019-nCoV saat masuk ke rumah sakit
All patients (n=41) ICU care (n=13) No ICU care (n=28) p value
White blood cell count(Hitung Sel darah putih) , × 10 9/L 6·2 (4·1–10·5) 11·3 (5·8–12·1) 5·7 (3·1–7·6) 0·011
<4 10/40 (25%) 1/13 (8%) 9/27 (33%) 0·041
4–10 18/40 (45%) 5/13 (38%) 13/27 (48%) ..
>10 12/40 (30%) 7/13 (54%) 5/27 (19%) ..
Netrofil, × 10 9/L 5·0 (3·3–8·9) 10·6 (5·0–11·8) 4·4 (2·0–6·1) 0·00069
Limfosit, × 10 9/L 0·8 (0·6–1·1) 0·4 (0·2–0·8) 1·0 (0·7–1·1) 0·0041
<1·0 26/41 (63%) 11/13 (85%) 15/28 (54%) 0·045
≥1·0 15/41 (37%) 2/13 (15%) 13/28 (46%) ..
Haemoglobin, g/L 126·0 (118·0–140·0) 122·0 (111·0–128·0) 130·5 (120·0–140·0) 0·20
Trombosit, × 10 9/L 164·5 (131·5–263·0) 196·0 (165·0–263·0) 149·0 (131·0–263·0) 0·45
<100 2/40 (5%) 1/13 (8%) 1/27 (4%) 0·45
≥100 38/40 (95%) 12/13 (92%) 26/27 (96%) ..
Prothrombin time, s 11·1 (10·1–12·4) 12·2 (11·2–13·4) 10·7 (9·8–12·1) 0·012
Activated partial thromboplastin time, s 27·0 (24·2–34·1) 26·2 (22·5–33·9) 27·7 (24·8–34·1) 0·57
D-dimer, mg/L 0·5 (0·3–1·3) 2·4 (0·6–14·4) 0·5 (0·3–0·8) 0·0042
Albumin, g/L 31·4 (28·9–36·0) 27·9 (26·3–30·9) 34·7 (30·2–36·5) 0·0066
Alanine aminotransferase, U/L 32·0 (21·0–50·0) 49·0 (29·0–115·0) 27·0 (19·5–40·0) 0·038
Aspartate aminotransferase, U/L 34·0 (26·0–48·0) 44·0 (30·0–70·0) 34·0 (24·0–40·5) 0·10
≤40 26/41 (63%) 5/13 (38%) 21/28 (75%) 0·025
>40 15/41 (37%) 8/13 (62%) 7/28 (25%) ..
Total bilirubin, mmol/L 11·7 (9·5–13·9) 14·0 (11·9–32·9) 10·8 (9·4–12·3) 0·011
Potassium, mmol/L 4·2 (3·8–4·8) 4·6 (4·0–5·0) 4·1 (3·8–4·6) 0·27
Sodium, mmol/L 139·0 (137·0–140·0) 138·0 (137·0–139·0) 139·0 (137·5–140·5) 0·26
Creatinine, μmol/L 74·2 (57·5–85·7) 79·0 (53·1–92·7) 73·3 (57·5–84·7) 0·84
≤133 37/41 (90%) 11/13 (85%) 26/28 (93%) 0·42
>133 4/41 (10%) 2/13 (15%) 2/28 (7%) ..
Creatine kinase, U/L 132·5 (62·0–219·0) 132·0 (82·0–493·0) 133·0 (61·0–189·0) 0·31
≤185 27/40 (68%) 7/13 (54%) 20/27 (74%) 0·21
>185 13/40 (33%) 6/13 (46%) 7/27 (26%) ..
Lactate dehydrogenase, U/L 286·0 (242·0–408·0) 400·0 (323·0–578·0) 281·0 (233·0–357·0) 0·0044
≤245 11/40 (28%) 1/13 (8%) 10/27 (37%) 0·036
>245 29/40 (73%) 12/13 (92%) 17/27 (63%) ..
Hypersensitive troponin I, pg/mL 3·4 (1·1–9·1) 3·3 (3·0–163·0) 3·5 (0·7–5·4) 0·08
>28 (99th percentile) 5/41 (12%) 4/13 (31%) 1/28 (4%) 0·017
Procalcitonin, ng/mL 0·1 (0·1–0·1) 0·1 (0·1–0·4) 0·1 (0·1–0·1) 0·031
<0·1 27/39 (69%) 6/12 (50%) 21/27 (78%) 0·0029
≥0·1 to <0·25 7/39 (18%) 3/12 (25%) 4/27 (15%) ..
≥0·25 to <0·5 2/39 (5%) 0/12 2/27 (7%) ..
≥0·5 3/39 (8%) 3/12 (25%)* 0/27 ..
Bilateral involvement of chest radiographs 40/41 (98%) 13/13 (100%) 27/28 (96%) 0·68
Cycle threshold of respiratory tract 32·2 (31·0–34·5) 31·1 (30·0–33·5) 32·2 (31·1–34·7) 0·39
BACA  Herd Immunity, Cara Ekstrim Basmi Wabah Covid19.
Data are median (IQR) or n/N (%), where N is the total number of patients with available data. p values comparing ICU care and no ICU care are from χ 2, Fisher’s exact test, or Mann-Whitney U test. 2019-nCoV=2019 novel coronavirus. ICU=intensive care unit.
* Complicated typical secondary infection during the first hospitalisation.

Jumlah darah pasien saat masuk menunjukkan leukopenia (jumlah sel darah putih kurang dari 4 × 109 / L; sepuluh [25%] dari 40 pasien) dan limfopenia (jumlah limfosit <1 · 0 × 109 / L; 26 [63%] pasien; tabel 2). Waktu protrombin dan tingkat D-dimer saat masuk lebih tinggi pada pasien ICU (median waktu protrombin 12 · 2 s [IQR 11 · 2–13 · 4]; median tingkat D-dimer 2 · 4 mg / L [0 · 6–14 · 4]) dibandingkan pasien non-ICU (waktu protrombin rata-rata 10 · 7 s [9 · 8-12 · 1], p = 0 · 012; tingkat median D-dimer 0 · 5 mg / L [0 · 3-0] · 8], p = 0 · 0042). Tingkat aspartat aminotransferase meningkat pada 15 (37%) dari 41 pasien, termasuk delapan (62%) dari 13 pasien ICU dan tujuh (25%) dari 28 pasien non-ICU. Troponin I yang hipersensitif (hs-cTnI) meningkat secara substansial pada lima pasien, di mana diagnosis cedera jantung terkait virus dibuat.

Pengukuran sitokin dan kemokin

Untuk mengkarakterisasi efek coronavirus pada produksi sitokin atau kemokin pada fase akut penyakit, sitokin plasma dan kemokin (IL1B, IL1RA, IL2, IL4, IL5, IL6, IL7, IL8 (juga dikenal sebagai CXCL8), IL9, IL10, IL12p70, IL13, IL15, IL17A, Eotaxin (juga dikenal sebagai CCL11), FGF2 dasar, GCSF (CSF3), GMCSF (CSF2), IFNγ, IP10 (CXCL10), MCP1 (CCL2), MIP1A (CCL3), MIP1B ( CCL4), PDGFB, RANTES (CCL5), TNFα, dan VEGFA diukur menggunakan panel Human Cytokine Standard 27-Plex Assays dan sistem Bio-Plex 200 (Bio-Rad, Hercules, CA, USA) untuk semua pasien sesuai dengan pabriknya. instruksi. Sampel plasma dari empat orang dewasa yang sehat digunakan sebagai kontrol untuk perbandingan silang. Waktu median dari dipindahkan ke rumah sakit yang ditunjuk untuk pengumpulan sampel darah adalah 4 hari (IQR 2-5).

Deteksi coronavirus dalam plasma

Setiap sampel plasma 80 μL dari pasien dan kontak ditambahkan ke 240 μL Trizol LS (10296028; Thermo Fisher Scientific, Carlsbad, CA, USA) di laboratorium Level 3 Keamanan Hayati. Total RNA diekstraksi dengan Direct-zol RNA Miniprep kit (R2050; penelitian Zymo, Irvine, CA, USA) sesuai dengan instruksi pabrik dan 50 μL elusi diperoleh untuk setiap sampel. 5 μL RNA digunakan untuk RT-PCR real-time, yang menargetkan gen NP menggunakan AgPath-ID One-Step RT-PCR Reagent (AM1005; Thermo Fisher Scientific). Konsentrasi campuran reaksi akhir primer adalah 500 nM dan probe 200 nM. RT-PCR waktu nyata dilakukan dengan menggunakan kondisi berikut: 50 ° C selama 15 menit dan 95 ° C selama 3 menit, 50 siklus amplifikasi pada 95 ° C selama 10 detik dan 60 ° C selama 45 detik. Karena kami tidak melakukan tes untuk mendeteksi virus menular dalam darah, kami menghindari istilah viraemia dan menggunakan RNAaemia sebagai gantinya. RNAaemia didefinisikan sebagai hasil positif untuk RT-PCR real-time dalam sampel plasma

BACA  Covid19 Outbreak: Konsultasi Kesehatan Melalui TELEMEDICINE dr widodo judarwanto, pediatrician

Kesimpulan

Baik SARS-CoV dan MERS-CoV diyakini berasal dari kelelawar, dan infeksi ini ditransmisikan langsung ke manusia dari musang pasar dan unta dromedaris, masing-masing.35 Penelitian ekstensif tentang SARS-CoV dan MERS-CoV telah mendorong penemuan banyak SARS coronavirus suka dan suka MERS pada kelelawar. Pada 2013, Ge dkk melaporkan seluruh rangkaian genom dari virus corona mirip SARS pada kelelawar dengan kemampuan untuk menggunakan ACE2 manusia sebagai reseptor, sehingga memiliki potensi replikasi dalam sel manusia. 2019-nCoV masih perlu dipelajari secara mendalam dalam kasus itu menjadi ancaman kesehatan global. Tes patogen cepat yang andal dan diagnosis banding yang layak berdasarkan deskripsi klinis sangat penting bagi dokter dalam kontak pertama mereka dengan pasien yang dicurigai. Karena potensi pandemi pada 2019-nCoV, pengawasan yang cermat sangat penting untuk memantau adaptasi host di masa depan, evolusi virus, infektivitas, transmisi, dan patogenisitas.

wp-1580094575522.jpg

Referensi

  • Ksiazek TG Erdman D Goldsmith CS et al. A novel coronavirus associated with severe acute respiratory syndrome. N Engl J Med. 2003; 348: 1953-1966
  • Kuiken T Fouchier RAM Schutten M et al; Newly discovered coronavirus as the primary cause of severe acute respiratory syndrome. Lancet. 2003; 362: 263-270
  • Prof Chaolin Huang, Yeming Wang, Prof Xingwang Li, MD , Prof Lili Ren, PhD. Prof Jianping Zhao, MD  Yi Hu, MD et al. Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China. The Lancet, January 24, 2020
  • Drosten C Günther S Preiser W et al. Identification of a novel coronavirus in patients with severe acute respiratory syndrome. N Engl J Med. 2003; 348: 1967-1976
  • de Groot RJ Baker SC Baric RS et al. Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV): announcement of the Coronavirus Study Group. J Virol. 2013; 87: 7790-7792
  • Zaki AM van Boheemen S Bestebroer TM Osterhaus ADME Fouchier RAM
    Isolation of a novel coronavirus from a man with pneumonia in Saudi Arabia.
    N Engl J Med. 2012; 367: 1814-1820
  • WHO. Summary of probable SARS cases with onset of illness from 1 November 2002 to 31 July 2003. https://www.who.int/csr/sars/country/table2004_04_21/en/ Date: Dec 31, 2003 Date accessed: January 19, 2020
  • Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV). http://www.who.int/emergencies/mers-cov/en/ Date: November, 2019 Date accessed: January 19, 2020
  • Novel coronavirus – China. http://www.who.int/csr/don/12-january-2020-novel-coronavirus-china/en/ Date: Jan 12, 2020 Date accessed: January 19, 2020
  • Novel coronavirus – Thailand (ex-China). http://www.who.int/csr/don/14-january-2020-novel-coronavirus-thailand/en/ Date: Jan 14, 2020 Date accessed: January 19, 2020
  • Novel coronavirus – Japan (ex-China). http://www.who.int/csr/don/17-january-2020-novel-coronavirus-japan-ex-china/en/ Date: Jan 17, 2020 Date accessed: January 19, 2020
  • Novel coronavirus – Republic of Korea (ex-China). http://www.who.int/csr/don/21-january-2020-novel-coronavirus-republic-of-korea-ex-china/en/ Date: Jan 21, 2020 Date accessed: January 23, 2020
  • First travel-related case of 2019 novel coronavirus detected in United States. https://www.cdc.gov/media/releases/2020/p0121-novel-coronavirus-travel-case.html
    Date: Jan 21, 2020 Date accessed: January 23, 2020
  • Tan W Zhao X Ma X et al. A novel coronavirus genome identified in a cluster of pneumonia cases — Wuhan, China 2019−2020. http://weekly.chinacdc.cn/en/article/id/a3907201-f64f-4154-a19e-4253b453d10c Date accessed: January 23, 2020
  • Sanz F Gimeno C Lloret T et al. Relationship between the presence of hypoxemia and the inflammatory response measured by C-reactive protein in bacteremic pneumococcal pneumonia. Eur Respir J. 2011; 38: 2492
  • Kidney disease: improving global outcomes (KDIGO) acute kidney injury work group KDIGO clinical practice guideline for acute kidney injury. https://kdigo.org/wp-content/uploads/2016/10/KDIGO-2012-AKI-Guideline  Date: March, 2012 Date accessed: January 23, 2020
  • Garner JS Jarvis WR Emori TG Horan TC Hughes JM CDC definitions for nosocomial infections, 1988. Am J Infect Control. 1988; 16: 128-140
  • Gao C Wang Y Gu X et al. Association between cardiac injury and mortality in hospitalized patients infected with avian influenza A (H7N9) virus. Crit Care Med. 2020; (published online Jan 20)
  • Perlman S Netland J Coronaviruses post-SARS: update on replication and pathogenesis. Nat Rev Microbiol. 2009; 7: 439-450
  • Lee N Hui D Wu A et al. A major outbreak of severe acute respiratory syndrome in Hong Kong. N Engl J Med. 2003; 348: 1986-1994
  • Assiri A Al-Tawfiq JA Al-Rabeeah AA et al. Epidemiological, demographic, and clinical characteristics of 47 cases of Middle East respiratory syndrome coronavirus disease from Saudi Arabia: a descriptive study. Lancet Infect Dis. 2013; 13: 752-761
    2
  • Wong CK Lam CWK Wu AKL et al. Plasma inflammatory cytokines and chemokines in severe acute respiratory syndrome. Clin Exp Immunol. 2004; 136: 95-103
  • Mahallawi WH Khabour OF Zhang Q Makhdoum HM Suliman BA. MERS-CoV infection in humans is associated with a pro-inflammatory Th1 and Th17 cytokine profile. Cytokine. 2018; 104: 8-13
  • He L Ding Y Zhang Q et al. Expression of elevated levels of pro-inflammatory cytokines in SARS-CoV-infected ACE2+ cells in SARS patients: relation to the acute lung injury and pathogenesis of SARS. J Pathol. 2006; 210: 288-297
  • Faure E Poissy J Goffard A et al. Distinct immune response in two MERS-CoV-infected patients: can we go from bench to bedside?. PLoS One. 2014; 9e88716
  • Falzarano D de Wit E Rasmussen AL et al. Treatment with interferon-α2b and ribavirin improves outcome in MERS-CoV-infected rhesus macaques. Nat Med. 2013; 19: 1313-1317
  • Stockman LJ Bellamy R Garner P. SARS: systematic review of treatment effects. PLoS Med. 2006; 3: e343
  • Lansbury L Rodrigo C Leonardi-Bee J Nguyen-Van-Tam J Lim WS. Corticosteroids as adjunctive therapy in the treatment of influenza. Cochrane Database Syst Rev. 2019; 2: CD010406
  • Arabi YM Mandourah Y Al-Hameed F et al. Corticosteroid therapy for critically ill patients with Middle East respiratory syndrome. Am J Respir Crit Care Med. 2018; 197: 757-767
  • WHO. Clinical management of severe acute respiratory infection when novel coronavirus (nCoV) infection is suspected. https://www.who.int/internal-publications-detail/clinical-management-of-severe-acute-respiratory-infection-when-novel-coronavirus-(ncov)-infection-is-suspected. Date: Jan 11, 2020 Date accessed: January 19, 2020
  • Chu CM. Role of lopinavir/ritonavir in the treatment of SARS: initial virological and clinical findings. Thorax. 2004; 59: 252-256
  • Arabi YM Alothman A Balkhy HH et al. Treatment of Middle East respiratory syndrome with a combination of lopinavir-ritonavir and interferon-β1b (MIRACLE trial): study protocol for a randomized controlled trial. Trials. 2018; 19: 81
  • Sheahan TP Sims AC Graham RL et al. Broad-spectrum antiviral GS-5734 inhibits both epidemic and zoonotic coronaviruses. Sci Transl Med. 2017; 9eaal3653
  • Sheahan TP Sims AC Leist SR et al. Comparative therapeutic efficacy of remdesivir and combination lopinavir, ritonavir, and interferon beta against MERS-CoV. Nat Commun. 2020; 11: 222
  • Cui J Li F Shi Z-L Origin and evolution of pathogenic coronaviruses. Nat Rev Microbiol. 2019; 17: 181-192
  • Ge X-Y Li J-L Yang X-L et al. Isolation and characterization of a bat SARS-like coronavirus that uses the ACE2 receptor. Nature. 2013; 503: 535-538
BACA  Sterilisasi Ultra Violet Cegah Covid19 Tak Dianjurkan WHO, Berbahaya Bagi Kulit

wp-1580267645014.jpg

 

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *

error

Enjoy this blog? Please spread the word :)