Tinjauan Kepustakaan: Epidemiologi Covid19

Spread the love

Tinjauan Kepustakaan: Epidemiologi Covid19

Widodo Judarwanto, Audi Yudhasmara

Literatur terbaru dan data resmi dari China CDC mengungkapkan epidemi COVID-19 menyebabkan lebih banyak infeksi dan kematian daripada SARS atau MERS, meskipun fakta bahwa tingkat fatalitas kasusnya jauh lebih rendah. SARS-CoV-2 tampaknya lebih menular daripada SARS-CoV atau MERS-CoV berdasarkan nilai R0 yang dihitung pada tahap awal wabah ini. Mayoritas orang yang terinfeksi tanpa gejala ringan dapat melepaskan virus dan menyebarkan virus ke orang lain, yang sangat menantang untuk mencegah penyebaran COVID-19. Oleh karena itu, pengawasan ketat sangat penting untuk mencegah penularan berkelanjutan. Intervensi aktif termasuk suplemen gizi, pengobatan simptomatik, dan pengobatan antivirus. Artikel ini dilindungi oleh hak cipta. Seluruh hak cipta. Vaksinasi profilaksis sangat dituntut untuk pencegahan epidemi atau pandem terkait virus yang muncul di masa depan

Pada 27 Februari 2020, berjangkitnya COVID-19 menyebabkan 82623 kasus yang dikonfirmasi dan 2858 kematian secara global, lebih dari Sindrom Pernafasan Akut Parah (SARS) (8273 kasus, 775 kematian) dan Sindrom Pernafasan Timur Tengah (MERS) (1139 kasus, 431 kematian) yang disebabkan masing-masing pada tahun 2003 dan 2013. COVID ‐ 19 telah menyebar ke 46 negara secara internasional. Tingkat fatalitas total COVID-19 diperkirakan 3,46% sejauh ini berdasarkan data yang dipublikasikan dari Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit Tiongkok (CDC Cina). Rata-rata masa inkubasi COVID-19 adalah sekitar 6,4 hari, berkisar 0-24 hari. Nomor reproduksi dasar (R0) COVID ‐ 19 berkisar 2-3,5 pada fase awal terlepas dari model prediksi yang berbeda, yang lebih tinggi dari SARS dan MERS. Sebuah studi dari Cina CDC menunjukkan mayoritas pasien (80,9%) dianggap pneumonia asimptomatik atau ringan tetapi melepaskan sejumlah besar virus pada fase awal infeksi, yang menimbulkan tantangan besar untuk mengandung penyebaran COVID-19. Penularan nosokomial adalah masalah berat lainnya. 3019 petugas kesehatan terinfeksi pada 12 Februari 2020, yang menyumbang 3,83% dari total infeksi, dan sangat membebani sistem kesehatan, terutama di Wuhan. Data epidemiologis dan klinis yang terbatas menunjukkan bahwa spektrum penyakit COVID-19 mungkin berbeda dari SARS atau MERS. Penngamatan tentang beberapa literatur terbaru tentang fitur genetik, epidemiologis, dan klinis COVID-19 dibandingkan dengan SARS dan MERS dan menekankan langkah-langkah khusus pada diagnosis dan intervensi potensial. Tinjauan ini akan meningkatkan pemahaman kita tentang fitur unik COVID19 dan meningkatkan tindakan pengendalian  di masa depan.

Epidemiologi COVID-19

  • Penularan penyakit menular harus bergantung pada tiga kondisi: sumber infeksi, rute penularan, dan host yang rentan. Ketika COVID-19 terus menyebar, lebih banyak fitur epidemiologis dari SARS-CoV-2 telah terungkap. Berdasarkan literatur yang baru-baru ini diterbitkan, kami membandingkan fitur transmisi SARS-CoV-2 dengan SARS-CoV dan MERS-CoV. Ketiga epidemi yang disebabkan oleh ketiga coronavirus ini terkait dengan pasar hewan liar. SARS dan MERS didefinisikan sebagai penyakit zoonosis, dan ditularkan oleh inang perantara (masing-masing musang dan unta dromedaris)
  • Studi terbaru menunjukkan trenggiling dan ular di pasar hewan liar cenderung menjadi inang perantara SARS-CoV-2. Transmisi manusia ke manusia dianggap sebagai mode transmisi utama. Menurut versi keenam pedoman untuk diagnosis dan perawatan untuk COVID-19 yang dikeluarkan oleh Komisi Kesehatan Nasional China, SARS-CoV-2 ditransmisikan melalui aspirasi pernapasan, tetesan, kontak, dan kotoran, dan transmisi aerosol sangat memungkinkan.
  • Chan JF dkk  melaporkan bahwa enam anggota keluarga mendapat COVID-19, tetapi tidak satu pun dari mereka memiliki kontak dengan pasar atau hewan Wuhan, meskipun dua telah mengunjungi rumah sakit Wuhan. Berdasarkan data dari CDC China, 58,3% kasus COVID-19 berada di Wuhan, sementara sisanya diimpor dari Wuhan. Wuhan adalah ibu kota provinsi Hubei China, dengan lebih dari 14 juta penduduk, dan merupakan pusat transportasi utama, yang meningkatkan kontak orang-ke-orang dan menambah kemungkinan mengekspor kasus ke lokasi lain. Data wabah awal sebagian besar mengikuti pertumbuhan eksponensial sebelum pelaksanaan strategi karantina oleh pemerintah pada 24 Januari 2020. Nilai-nilai reproduksi dasar (R0) COVID-19 pada tahap awal dihitung antara 2 dan 3,5, menunjukkan bahwa satu pasien dapat menularkan penyakit ini ke dua hingga tiga orang lain 17-20, yang lebih tinggi dari SARS dan MERS. Analisis filodinamik berdasarkan 52 sekuens genom dari galur SARS-CoV-2 yang diambil sampel di berbagai negara yang tersedia untuk umum di GISAID menunjukkan perkiraan laju evolusi rata-rata adalah 7,8 x 10-4 subs / situs / tahun (kisaran 1,1×10-4–15×10-4), yang merupakan sejalan dengan SARS dan MERS, dan waktu rata-rata leluhur bersama terbaru (tMRCA) adalah 73 hari21. Dengan penerapan strategi isolasi yang diberlakukan, R0 diperkirakan akan menurun dalam beberapa hari mendatang. Masa inkubasi rata-rata adalah sekitar 6,4 hari (berkisar dari 0 hingga 24 hari)
  • Mirip dengan SARS dan MERS, penularan nosokomial adalah masalah parah pada COVID-19, dan bahkan lebih buruk. Sebuah studi retrospektif baru-baru ini9 menunjukkan bahwa total 1.716 petugas kesehatan terinfeksi, terhitung 3,84% dari total kasus. Infeksi nosokomial sangat membebani sistem kesehatan dan menghambat individu yang terinfeksi dini untuk mendapatkan bantuan medis segera, oleh karena itu mengakibatkan tingkat fatalitas kasus yang tinggi di Wuhan. Di Wuhan saja, 1080 petugas kesehatan terinfeksi, sebaliknya tingkat fatalitas kasus Wuhan. adalah yang tertinggi.
  • Wang D dkk melaporkan bahwa di antara 138 pasien rawat inap dengan COVID-19, 41% pasien diduga terinfeksi melalui transmisi terkait rumah sakit, 26% pasien menerima perawatan ICU, dan mortalitas adalah 4,3%. Banyak perawatan pernapasan untuk pasien yang sakit kritis dianggap sebagai faktor risiko tinggi untuk penularan nosokomial, seperti intubasi, ventilasi manual oleh resuscitator, ventilasi noninvasif, kanula nasal aliran tinggi, pemeriksaan bronkoskopi, pengisapan dan transportasi pasien, dll. Tanpa diduga, sebagian besar penularan nosokomial terjadi melalui kontak antara dokter dan pengunjung tanpa gejala COVID-19 yang ringan pada fase awal wabah ini. Demikian pula, penularan presimptomatik terjadi melalui keluarga 25-27 dan pertemuan sosial, seperti jamuan makan, kegiatan gereja, olahraga, bepergian dengan kapal pesiar, dan sebagainya. Transmisi vertikal dilaporkan secara sporadis di beberapa media tetapi belum terbukti.
  • Chen dkk menyelidiki sembilan wanita hamil dengan COVID-19 pada trimester ketiga mereka yang menjalani operasi caesar. SARS-CoV-2 diuji dalam cairan amniotik, darah tali pusat, usap tenggorokan neonatal, dan sampel ASI dari enam wanita hamil dengan COVID-19 pneumonia, dan mendapat semua hasil negatif. Tidak ada neonatus yang memiliki tanda-tanda klinis infeksi. Hasil ini menunjukkan tidak ada infeksi janin intrauterin terjadi sebagai akibat dari infeksi COVID-19 selama tahap kehamilan thelate.
  • Studi sebelumnya juga tidak menunjukkan bukti infeksi perinatal dari SARS-CoV atau MERS-CoV selama kehamilan. Namun, neonatus yang lahir dari wanita hamil dengan pneumonia COVID-19 positif mengidap infeksi SARS-CoV-2 36 jam setelah kelahiran di Rumah Sakit Tongji Wuhan. Adalah masuk akal untuk mengasumsikan bahwa bayi baru lahir dapat terinfeksi, baik dalam rahim atau perinatal, dan dengan demikian bayi baru lahir harus ditempatkan dalam isolasi untuk menghindari paparan ke sumber infeksi.
  • Dalam hal populasi yang rentan, semua kelompok pada umumnya rentan terhadap COVID-19 tanpa memandang usia atau jenis kelamin. Pasien berusia 30 hingga 79 tahun menyumbang 86,6% dari semua kasus9. Usia rata-rata pasien adalah 47 tahun. Tidak seperti SARS dan MERS, pasien yang didiagnosis sebagai COVID-19 memiliki viral load yang tinggi bahkan ketika mereka tidak mengalami demam atau gejala ringan31. Titer tinggi SARS-CoV-2 terdeteksi pada pelancong yang baru-baru ini mengunjungi Wuhan dan tidak memiliki.
  • Diterima Articlefever atau gejala ringan di Amerika Serikat dan Jerman dan tempat-tempat lain. Sebuah penelitian menunjukkan viral load yang tinggi terdeteksi pada spesimen pernapasan atas pasien dengan COVID-19, dan pola pelepasan virus pada pasien menyerupai pasien dengan influenza33. Ini menunjukkan bahwa SARS-CoV-2 mungkin bertahan selama beberapa waktu seperti virus influenza.
BACA  IDI: Identitas Pasien Positif Covid-19 Boleh Diungkap

Referensi

  • Chen Y, Liu Q, Guo D. Emerging coronaviruses: Genome structure, replication, and pathogenesis. J Med Virol. 2020;92(4):418-423.9.
  • [The epidemiological characteristics of an outbreak of 2019 novel coronavirus diseases (COVID-19) in China]. Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi. 2020;41(2):145-151.
  • Zumla A, Chan JF, Azhar EI, Hui DS, Yuen KY. Coronaviruses – drug discovery and therapeutic options. Nat Rev Drug Discov. 2016;15(5):327-347.This article is protected by copyright. All rights reserved.
  • Lu R, Zhao X, Li J, et al. Genomic characterisation and epidemiology of 2019 novel coronavirus: implications for virus origins and receptor binding. Lancet. 2020
  • .Li X, Zai J, Zhao Q, et al. Evolutionary history, potential intermediate animal host, and cross-species analyses of SARS-CoV-2. J Med Virol.2020.
  • Phan T. Genetic diversity and evolution of SARS-CoV-2. Infect Genet Evol. 2020:104260.14.Wrapp DN, Wang & Corbett, Kizzmekia & Goldsmith, Jory & Hsieh, Ching-Lin & Abiona, Olubukola & Graham, Barney & Mclellan, Jason. Cryo-EM Structure of the 2019-nCoV Spike in the Prefusion Conformation..bioRxiv. 2020.
  • Tommy Tsan-Yuk Lam MH-HS, Hua-Chen Zhu. Identification of 2019-nCoV related coronaviruses in Malayan pangolins in southern China. 2020.
  • Ji WaW, Wei and Zhao, Xiaofang and Zai, Junjie and Li, Xingguang. Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross-species transmission from snake to human. Journal of Medical Virology. 2020;92
  • Li Q, Guan X, Wu P, et al. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia. N Engl J Med. 2020.This article is protected by copyright. All rights reserved.
  • .Riou J, Althaus CL. Pattern of early human-to-human transmission of Wuhan 2019 novel coronavirus (2019-nCoV), December 2019 to January 2020. Euro Surveill. 2020;25(4).19.Wu JT, Leung K, Leung GM. Nowcasting and forecasting the potential domestic and international spread of the 2019-nCoV outbreak originating in Wuhan, China: a modelling study. Lancet. 2020.
  • Liu Y, Gayle AA, Wilder-Smith A, Rocklov J. The reproductive number of COVID-19 is higher compared to SARS coronavirus. J Travel Med. 2020.21.Lai A, Bergna A, Acciarri C, Galli M, Zehender G. Early Phylogenetic Estimate of the Effective Reproduction Number Of Sars-CoV-2. J Med Virol. 2020.
  • Backer JA, Klinkenberg D, Wallinga J. Incubation period of 2019 novel coronavirus (2019-nCoV) infections among travellers from Wuhan, China, 20-28 January 2020. Euro Surveill. 2020;25(5).
  • Wang D, Hu B, Hu C, et al. Clinical Characteristics of 138 Hospitalized Patients With 2019 Novel Coronavirus-Infected Pneumonia in Wuhan, China. Jama. 2020.
  • Respiratory care committee of Chinese Thoracic S. [Expert consensus on preventing nosocomial transmission during respiratory care for critically ill patients infected by 2019 novel coronavirus pneumonia]. Zhonghua Jie He He Hu Xi Za Zhi. 2020;17(0):E020.
  • Tong ZD, Tang A, Li KF, et al. Potential Presymptomatic Transmission of SARS-CoV-2, Zhejiang Province, China, 2020. Emerg Infect Dis. 2020;26(5).
  • Bai SL, Wang JY, Zhou YQ, et al. [Analysis of the first cluster of cases in a family of novel coronavirus pneumonia in Gansu Province]. Zhonghua Yu Fang Yi Xue Za Zhi. 2020;54(0):E005.
  • Rocklov J, Sjodin H, Wilder-Smith A. COVID-19 outbreak on the Diamond Princess cruise ship: estimating the epidemic potential and effectiveness of public health countermeasures. J Travel Med. 2020.
  • Huijun Chen P, Juanjuan Guo M, Chen Wang P, et al. Clinical characteristics and intrauterine vertical transmission potential of COVID-19 infection in nine pregnant women: a retrospective review of medical records. Lancet 2020.
  • Rasmussen SA, Smulian JC, Lednicky JA, Wen TS, Jamieson DJ. Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) and Pregnancy: What obstetricians need to know. Am J Obstet Gynecol. 2020.
  • Guan WJ, Ni ZY, Hu Y, et al. Clinical Characteristics of Coronavirus Disease 2019 in China. N Engl J Med. 2020.31.Holshue ML, DeBolt C, Lindquist S, et al. First Case of 2019 Novel Coronavirus in the United States. N Engl J Med. 2020.
  • Hoehl S, Berger A, Kortenbusch M, et al. Evidence of SARS-CoV-2 Infection in Returning Travelers from Wuhan, China. N Engl J Med. 2020.
  • Zou L, Ruan F, Huang M, et al. SARS-CoV-2 Viral Load in Upper Respiratory Specimens of Infected Patients. New England Journal of Medicine. 2020.
BACA  Penyakit Coronavirus-2019 (COVID-19) Pada Anak

 

 

Leave a Reply

Your email address will not be published. Required fields are marked *